对于那些保守治疗无效的肾结石患者来说，只能通过手术治疗来取石了，一般手术取石有以下方法。1、盂切开取石术术式较为简单。它适用于单纯性肾盂结石和较大的肾盏结石2、萎缩性肾实质切开取石术术式较为复杂，对肾血供干扰较少，能够尽量保护肾组织。它适用于鹿角形肾结石、多发性肾结石以及结石合并肾盏颈部狭窄需要同时整形者。3、部分切除术方法是将肾上极或肾下极连同结石一并切除。适用于肾上盏或肾下盏单校的多发性结石，尤其是合并盏颈狭窄、或因此形成“结石袋”而存在明显结石复发倾向者。4、肾脏切除术
适用于结石并发肾积水或肾积脓而导致肾功丧失者，但前提是对侧肾功能正常。