大多数肾囊肿是良性病变，良性肿瘤不会转移；少数肾囊肿会发生恶变，若病情严重，癌细胞可能向肺、肝脏、脑、骨骼等部位转移，影响生存期。
肾囊肿是临床上常见疾病，临床上把肾囊肿分为四级，一般一到三级肾囊肿为良性病变，不会出现转移。直径较小囊肿暂时不用治疗，直径较大囊肿，出现压迫症状可选择手术切除。
如果囊肿是四级，恶变可能性很大。此时进行肾脏CT平扫或增强检查，可看到肾囊肿囊壁明显增厚，囊内血流充盈，出现出血性坏死，表明肾囊肿已发生恶变，需积极手术切除病灶，术后还可进行淋巴清扫等辅助治疗。否则病情进一步加重，向远端转移，较常见转移部位是肝脏、肺部、大脑、骨骼等。