牙线上的蜡一般对身体无害，正规牙线使用的蜡通常是食品级或医用级材料。牙线表面的蜡层主要作用是帮助牙线更容易滑入牙缝，同时减少使用时的摩擦不适感。
牙线生产过程中使用的蜡质材料需符合国家相关安全标准，常见成分包括微晶蜡、聚乙烯蜡等惰性物质，这些成分不会被人体吸收，也不会与口腔黏膜发生化学反应。正常使用牙线时，蜡层仅会微量脱落并被唾液稀释，即使少量吞咽也会通过消化道排出体外。临床研究未发现牙线蜡层导致过敏或中毒的案例，对孕妇、儿童等特殊人群同样安全。
极少数情况下，若使用劣质牙线可能含有工业蜡或添加剂，长期接触可能刺激牙龈。购买时应选择包装完整、标注成分的正规产品，避免选择有刺鼻气味或明显脱蜡的牙线。对蜡质过敏体质者，可选用无蜡牙线或水牙线替代。
日常使用牙线时，建议每天清洁一次，避免用力过大损伤牙龈。若使用后出现口腔黏膜红肿、灼痛等异常反应，应立即停用并漱口，必要时就医检查。同时注意将牙线存放在阴凉干燥处，避免高温导致蜡质融化变质。