鼻窦骨瘤手术后遗症一般不严重，少数患者可能出现鼻腔粘连、嗅觉减退或脑脊液漏等并发症。鼻窦骨瘤是生长缓慢的良性肿瘤，手术切除后多数预后良好。
鼻窦骨瘤手术通常采用内镜微创技术，创伤较小且恢复较快。术后常见轻微鼻塞或鼻腔分泌物增多，通常1-2周内逐渐缓解。手术区域可能出现暂时性肿胀或淤血，遵医嘱使用生理盐水冲洗鼻腔有助于减轻不适。规范操作下严重并发症概率较低，术后定期复查鼻内镜可及时发现异常。
极少数情况下，若肿瘤位置邻近颅底或眼眶，术中可能损伤周围神经或血管。术后可能出现持续性头痛、视力改变或脑脊液鼻漏，需立即就医处理。既往有慢性鼻窦炎或多次鼻部手术史的患者，术后鼻腔粘连风险可能略高，需加强术后鼻腔护理。
术后应避免用力擤鼻、剧烈运动及高空飞行，防止压力变化影响创面愈合。饮食宜清淡，多摄入富含维生素C的西蓝花、猕猴桃等食物促进黏膜修复。若出现发热、剧烈头痛或鼻腔异常液体流出，应及时返院检查。多数患者术后1-3个月可完全恢复，远期生活质量不受明显影响。