月经未完全干净时同房可能会对健康产生影响。若月经量极少且双方注意卫生，通常不会造成严重后果；若月经量较多或卫生条件差，可能增加感染风险或导致其他问题。
月经期子宫内膜处于脱落状态，宫颈口轻微扩张，此时同房可能将外界细菌带入生殖道。阴道内积存的经血为细菌繁殖提供了环境，可能诱发阴道炎、宫颈炎等炎症。男性生殖器也可能携带细菌，性行为过程中可能将这些细菌带入女性体内。使用避孕套可降低部分风险，但无法完全避免摩擦对充血组织的刺激。
少数情况下可能引发严重问题。性行为时子宫收缩可能使经血逆流至盆腔，增加子宫内膜异位症概率。剧烈运动可能加重盆腔充血状态，延长出血时间。若本身存在妇科炎症或免疫力低下，感染风险会显著上升，可能出现发热、腹痛等急性症状。有避孕需求者需注意，月经期仍存在意外妊娠可能。
建议等待月经完全干净后再恢复性生活。若已发生性行为且出现异常出血、分泌物异味、下腹疼痛等症状，应及时就医检查。日常应注意保持外阴清洁，同房前后做好清洁工作，避免经期盆浴或游泳。规律作息和均衡饮食有助于维持免疫力，降低感染风险。有反复月经期不适者建议进行妇科检查，排除器质性疾病。