辅酶Q10可能有助于改善慢性疲劳综合征的部分症状，但需结合个体情况综合治疗。慢性疲劳综合征可能与线粒体功能障碍、氧化应激等因素有关，辅酶Q10作为线粒体能量代谢的辅助因子，可尝试用于缓解疲劳感。
慢性疲劳综合征患者体内常存在能量代谢异常，辅酶Q10能促进三磷酸腺苷合成，改善细胞能量供应。部分研究显示每日补充辅酶Q10可减轻疲劳程度，缩短恢复时间，尤其对伴随肌肉酸痛的患者效果更明显。临床常用剂量需根据血清辅酶Q10水平调整，通常需要持续补充数周才能观察到效果。但单纯依赖辅酶Q10不能完全消除症状，需配合认知行为疗法等综合干预。
少数患者使用辅酶Q10可能出现胃肠不适或过敏反应，合并使用抗凝药物时需警惕出血风险。对线粒体基因突变导致的严重能量代谢障碍，辅酶Q10的改善作用有限。妊娠期、哺乳期女性及肝肾功能不全者应在医生指导下调整用量，避免与某些降糖药合用影响疗效。
建议慢性疲劳综合征患者保持规律作息，进行适度有氧运动如游泳、快走等，饮食注意补充优质蛋白和B族维生素。若持续疲劳超过6个月且影响日常生活，应及时到神经内科或康复科就诊，完善甲状腺功能、病毒抗体等检查排除其他疾病。治疗期间可记录症状变化日记，帮助医生评估辅酶Q10的疗效。