肾囊肿一般不会直接变成尿毒症，但多囊肾病等特殊类型可能增加尿毒症风险。肾囊肿与尿毒症的关联主要取决于囊肿类型、数量及是否引发肾功能进行性损害。
单纯性肾囊肿是成年人常见的良性病变，通常为单发或少量囊肿，生长缓慢且极少影响肾功能。这类囊肿多由肾小管憩室发展而来，体积较小时无明显症状，仅在体检时被发现。即使囊肿增大压迫周围组织，也仅可能引起腰部钝痛或血尿，通过超声引导下穿刺抽液或腹腔镜手术即可有效干预，不会导致肾小球滤过率下降或尿毒症。
多囊肾病作为遗传性疾病，表现为双肾弥漫性多发囊肿，可占据正常肾实质空间并逐渐导致肾功能衰竭。随着囊肿数量增多和体积增大，患者可能出现高血压、蛋白尿及血肌酐升高，最终约半数患者会进入尿毒症期。此类患者需定期监测肾功能，通过控制血压、限制蛋白摄入等措施延缓病情进展，必要时需进行血液透析或肾移植治疗。
建议肾囊肿患者每6-12个月复查泌尿系统超声和肾功能，若出现持续腰痛、血尿或血压异常升高应及时就诊。日常需保持每日1500-2000毫升饮水量，避免剧烈运动导致囊肿破裂，高血压患者应将血压控制在130/80毫米汞柱以下。多囊肾病患者需进行家族遗传筛查，妊娠前应接受遗传咨询。