无痛胃镜与普通胃镜的主要区别在于是否使用麻醉药物，无痛胃镜在检查过程中使用静脉麻醉药物使患者处于短暂睡眠状态，普通胃镜则是在患者清醒状态下完成检查。
无痛胃镜通过静脉注射麻醉药物使患者进入短暂睡眠状态，患者在检查过程中不会感到任何不适或疼痛，检查结束后很快苏醒，通常不会留下不良记忆。普通胃镜不需要使用麻醉药物，患者在清醒状态下完成检查，检查过程中可能会感到恶心、呕吐等不适，但检查结束后可以立即恢复正常活动。无痛胃镜需要麻醉医生参与，检查前需要进行麻醉评估，检查后需要短暂观察，确保麻醉药物代谢完毕。普通胃镜不需要麻醉医生参与，检查流程相对简单，检查后可以立即离开。
无痛胃镜适合对疼痛敏感、容易紧张的患者，以及需要较长时间检查的情况。普通胃镜适合身体状况不适合麻醉、需要立即恢复活动的患者。两种检查方式在诊断准确性上没有明显差异，都能清晰观察胃部病变。检查前需要空腹，避免食物影响观察效果。检查后短时间内避免进食刺激性食物，注意观察是否有不适反应。