鲫鱼汤发苦通常可以饮用，但需排查具体原因。苦味可能由鱼胆破裂、内脏未清理干净或烹饪火候不当引起，若未出现变质或严重异味，少量饮用一般无碍。
鲫鱼胆汁含有苦味成分，处理时若弄破鱼胆会导致汤汁发苦。建议宰杀时避开胆囊位置，用清水反复冲洗腹腔。未彻底清除的鱼鳃、腹膜或淤血也可能残留苦味物质，需仔细去除所有内脏及黑色内膜。高温久煮会使鱼肉蛋白质分解产生微量苦味氨基酸，控制炖煮时间在30分钟内可避免。部分水域鲫鱼因藻类摄食可能自带土腥味，可通过加姜片、料酒焯水去腥。
出现苦味伴随鱼肉松散、黏液增多或汤体浑浊时，可能已腐败变质须丢弃。误食被工业废水污染的鲫鱼会导致重金属超标，其苦味往往伴有金属涩感。少数人对鲫鱼过敏时可能产生味觉异常，饮用后出现唇舌麻木需立即停止。使用苦味中药材如陈皮、茯苓配伍时，也可能导致汤品正常药苦。
饮用苦味鲫鱼汤后若无腹痛、腹泻等不适可继续观察。日常建议选择鲜活鲫鱼，宰杀后1小时内烹饪，搭配白萝卜或豆腐能中和异味。脾胃虚弱者应控制单次饮用量，冷藏保存不超过24小时。持续苦味过重或伴有异常症状时应停止食用并咨询医师。