甲氧西林和苯唑西林均属于β-内酰胺类抗生素中的耐酶青霉素，两者具有相似的抗菌谱和耐药机制，但化学结构、临床应用及耐药性表现存在差异。
1、化学结构：
甲氧西林和苯唑西林的核心结构均为6-氨基青霉烷酸，但侧链修饰不同。甲氧西林在侧链引入甲氧基，苯唑西林则采用苯基异噁唑基团。这种差异使苯唑西林对胃酸稳定性更高，适合口服给药，而甲氧西林仅限注射使用。
2、抗菌机制：
两者均通过抑制细菌细胞壁合成发挥杀菌作用，对产青霉素酶的金黄色葡萄球菌有效。但甲氧西林对β-内酰胺酶的稳定性低于苯唑西林，导致其更易诱导细菌产生耐药性，这也是甲氧西林逐渐被临床淘汰的重要原因。
3、耐药性关联：
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）对苯唑西林通常存在交叉耐药。检测MRSA时，实验室常以苯唑西林作为替代指示药物，因其稳定性优于甲氧西林。两者耐药性均与青霉素结合蛋白2a（PBP2a）的获得性改变有关。
4、临床应用：
苯唑西林目前仍用于敏感葡萄球菌感染的治疗，包括皮肤软组织感染、骨髓炎等。甲氧西林因耐药率高、半衰期短已基本退出临床，仅保留其名称用于细菌耐药性分类（如MRSA的定义）。
5、不良反应：
两者均可引起过敏反应、胃肠道不适等典型青霉素类不良反应。但甲氧西林更易导致间质性肾炎，苯唑西林则可能引发胆汁淤积性肝炎，这与两者代谢途径差异相关。
使用β-内酰胺类抗生素期间需监测肝肾功能，避免与丙磺舒等影响肾脏排泄的药物联用。出现皮疹、发热等过敏症状应立即停药。对于MRSA感染，需换用万古霉素、利奈唑胺等特殊抗菌药物，不建议尝试甲氧西林或苯唑西林治疗。日常应注重手卫生，避免耐药菌传播。