阴茎短小可能由先天性发育异常、激素水平异常两个主要原因引起。阴茎短小通常表现为阴茎长度低于同龄人平均水平，可能与遗传因素、内分泌疾病等因素有关。
1、先天性发育异常
先天性发育异常是导致阴茎短小的常见原因之一。部分男性在胚胎发育阶段可能出现生殖器发育不全的情况，这与遗传基因缺陷或孕期母体接触有害物质有关。先天性尿道下裂、隐匿性阴茎等畸形也可能伴随阴茎短小症状。这类情况通常在儿童期即可被发现，需通过专业检查评估发育状况。
2、激素水平异常
雄性激素分泌不足会直接影响阴茎发育，常见于下丘脑-垂体-性腺轴功能异常。克氏综合征、垂体功能减退等疾病会导致睾酮水平低下，使青春期阴茎发育停滞。甲状腺功能减退、肾上腺皮质功能异常等内分泌疾病也可能干扰激素平衡。这类患者往往伴随第二性征发育迟缓、体毛稀疏等表现。
存在阴茎短小疑虑时建议尽早就诊泌尿外科或内分泌科，通过激素检测、染色体分析等明确病因。日常需保持健康生活方式，避免接触环境内分泌干扰物。青春期前发现异常可通过激素替代治疗促进发育，成年后以功能康复和心理疏导为主，严重者需评估手术矫正的必要性。规律作息、均衡营养对维持正常激素分泌具有积极作用。