电子喉镜和鼻内镜的主要区别在于检查部位、功能设计和临床应用范围。电子喉镜主要用于喉部及下咽部检查，而鼻内镜则针对鼻腔、鼻窦及鼻咽部病变。
电子喉镜采用软性或硬性镜体，前端配备高清摄像头与光源，可经口腔或鼻腔进入，实时观察声带、会厌等喉部结构。其镜体较长且可弯曲，适合检查深部喉腔病变，如声带息肉、喉癌等，部分型号具备活检通道便于取样。鼻内镜镜体较短且多呈直型或小角度弯曲，直径较细，专为狭窄的鼻腔设计，可清晰显示鼻甲、鼻窦开口及鼻咽部，常用于鼻窦炎、鼻息肉或鼻出血的诊断。两种器械均采用冷光源避免组织灼伤，但电子喉镜的放大倍数通常更高以识别微小喉部病变。
鼻内镜在操作时需配合表面麻醉，经前鼻孔进入，检查过程中可能需调整体位观察不同鼻窦区域。电子喉镜若经鼻插入需预先收缩鼻腔，经口途径则需压舌暴露喉部。两种检查均可能引起短暂不适，但电子喉镜对咽反射敏感者刺激更明显。从成像特点看，鼻内镜侧重广角视野覆盖鼻腔整体结构，电子喉镜则强调对声带振动等动态功能的细节捕捉。
选择检查方式需根据症状定位，持续性声音嘶哑、吞咽梗阻优先考虑电子喉镜，反复鼻塞、流脓涕则适用鼻内镜。部分复杂病例可能需联合使用。两种检查前均应禁食，佩戴活动义齿者需提前取出，检查后避免立即进食辛辣食物。若出现严重疼痛或出血需及时复诊。