检查腹部疾病时，MR和CT各有优势，具体选择需根据病情特点决定。MR更适合评估软组织病变和血管结构，CT则对急腹症和钙化灶更敏感。
MR在腹部检查中具有无辐射、多参数成像的优势，对肝脏、胰腺、盆腔器官等软组织的分辨率较高，能清晰显示肿瘤、炎症及血管畸形。弥散加权成像可早期发现微小病灶，动态增强扫描有助于鉴别良恶性肿瘤。但MR检查时间长，对患者配合度要求高，且体内有金属植入物者可能受限。
CT检查速度快，对急性腹痛、肠梗阻、消化道穿孔等急症具有诊断优势，能快速明确出血灶、游离气体或结石位置。高分辨率CT可清晰显示器官钙化、淋巴结肿大及腹膜后病变。但CT存在电离辐射，孕妇及儿童需谨慎选择，增强扫描还需考虑碘对比剂过敏风险。
建议根据具体症状和疑似疾病选择检查方式，复杂病例可联合应用。检查前需空腹4-6小时，去除金属物品，增强检查需提前评估肾功能。最终应由专科医生综合临床表现、既往检查结果及患者个体情况决定优选方案。