支气管囊肿是否需要手术取决于囊肿大小、位置及症状。多数体积较小且无症状的支气管囊肿无须手术，定期随访即可；若囊肿较大、引发反复感染或压迫周围组织，通常建议手术切除。手术方式主要有胸腔镜下囊肿切除术、开胸囊肿切除术两种。
支气管囊肿是胚胎期支气管发育异常形成的先天性病变，多数位于纵隔或肺内。囊肿较小时可能长期无症状，仅在体检时偶然发现。这类囊肿生长缓慢，恶变概率极低，通过胸部CT或核磁共振定期观察其变化即可。若囊肿未增大且未影响呼吸功能，无须特殊处理，但需每6-12个月复查影像学检查。
当囊肿直径超过3厘米、合并感染或压迫气管时，可能出现咳嗽、胸痛、呼吸困难等症状。反复感染可能导致囊肿与支气管相通形成瘘管，增加治疗难度。此时手术切除是根治性方案，胸腔镜手术创伤小、恢复快，适用于多数病例；开胸手术则用于位置特殊或粘连严重的复杂囊肿。术后需预防性使用抗生素如头孢呋辛酯片、阿莫西林克拉维酸钾分散片，并监测肺功能恢复情况。
术后应避免剧烈运动1-2个月，饮食以高蛋白、高维生素食物为主，如鱼类、西蓝花等促进组织修复。定期复查胸部影像学确认无复发，若出现发热、咳脓痰等感染迹象需及时就医。合并慢性呼吸道疾病者需加强呼吸锻炼，如腹式呼吸训练改善肺功能。