鹦鹉热需要与流感、支原体肺炎、细菌性肺炎、肺结核、军团菌肺炎等疾病相鉴别。鹦鹉热是由鹦鹉热衣原体感染引起的人畜共患病，临床表现与呼吸道感染性疾病相似，需通过实验室检测明确诊断。
1、流感
流感由流感病毒引起，表现为高热、头痛、肌肉酸痛等全身症状，与鹦鹉热初期症状相似。流感通常有季节性流行特征，可通过咽拭子病毒抗原检测鉴别。治疗可选用磷酸奥司他韦胶囊、扎那米韦吸入粉雾剂等抗病毒药物，重症需住院观察。
2、支原体肺炎
支原体肺炎多由肺炎支原体感染导致，常见刺激性干咳、低热等症状，胸部X线显示间质性改变。与鹦鹉热不同的是，支原体肺炎患者血清支原体IgM抗体阳性，可使用阿奇霉素片、克拉霉素缓释片等大环内酯类药物治疗。
3、细菌性肺炎
细菌性肺炎起病急骤，常见咳黄脓痰、胸痛等症状，血常规显示中性粒细胞升高。肺炎链球菌感染可用阿莫西林克拉维酸钾片，金黄色葡萄球菌感染需用注射用头孢唑林钠。鹦鹉热患者痰培养通常无致病菌生长。
4、肺结核
肺结核患者多有盗汗、消瘦等消耗症状，胸部CT可见空洞或树芽征。痰涂片抗酸染色阳性可确诊，需规范使用异烟肼片、利福平胶囊等抗结核药物。鹦鹉热患者结核菌素试验通常为阴性。
5、军团菌肺炎
军团菌肺炎常见于空调系统污染环境，伴腹泻、精神异常等肺外表现。尿抗原检测阳性可确诊，需使用左氧氟沙星注射液治疗。鹦鹉热与军团菌肺炎均可出现多系统损害，但病原学检测结果不同。
出现持续发热、咳嗽等症状时应尽早就医，医生会根据流行病学史、临床表现和实验室检查进行鉴别诊断。确诊鹦鹉热需采用血清学检测或PCR技术检测鹦鹉热衣原体核酸，治疗首选四环素类药物。日常应避免接触病禽及其分泌物，处理禽类时做好个人防护。