PETCT和核磁共振各有优势，PETCT在肿瘤筛查和代谢评估方面更优，核磁共振在软组织成像和神经系统疾病诊断中更具优势。
PETCT结合正电子发射断层扫描和计算机断层扫描技术，能清晰显示病灶的代谢活性，对早期肿瘤、转移灶的检出率较高，尤其适用于肺癌、淋巴瘤等恶性肿瘤的分期评估。该检查需注射放射性示踪剂，辐射量相对较大，但单次检查的辐射风险可控。核磁共振利用磁场和射频脉冲成像，无电离辐射，对脑组织、脊髓、关节软骨等软组织的分辨率极高，常用于脑卒中、椎间盘突出、韧带损伤等疾病的诊断。其检查时间较长，噪音明显，且对体内有金属植入物的患者存在禁忌。
PETCT的局限性在于对解剖结构细节的显示不如核磁共振清晰，且费用较高。核磁共振则对钙化灶、骨皮质等硬组织显像效果较差，对患者配合度要求更高。两种检查的适用性取决于具体疾病类型，例如癫痫患者优先选择核磁共振，而癌症患者可能需联合PETCT评估全身情况。
选择检查方式时应遵循临床指征，医生会综合考量疾病特点、检查目的和患者个体情况。检查前需详细告知医生既往病史、过敏史及体内植入物情况，检查后注意多饮水促进造影剂排泄。若检查结果异常，应及时专科就诊进一步评估。