痰检未检出结核菌仍需根据临床症状决定是否继续检查。结核病诊断需结合影像学、免疫学检测及临床症状综合判断，痰检阴性不能完全排除感染可能。
痰检是结核病诊断的重要方法，但存在一定局限性。当患者出现持续咳嗽、低热、盗汗等典型症状时，即使初次痰检阴性，仍建议进行重复痰检。结核分枝杆菌在痰液中可能呈现间歇性排菌特征，连续3天采集晨痰送检可提高检出率。对于高度疑似病例，可采用支气管肺泡灌洗液或组织活检等侵入性检查。X线胸片显示上肺野浸润影、空洞形成等典型表现时，应进一步行结核菌素试验或γ-干扰素释放试验等免疫学检测。
部分特殊人群可能出现痰检假阴性结果。免疫功能低下者、儿童及肺外结核患者细菌载量较低，痰检阳性率显著下降。糖尿病患者合并肺结核时，肺部病变常表现为中下肺野浸润，痰菌阳性率较普通患者低。使用抗结核药物后2-4周内，痰菌转阴不能作为停药的唯一标准。对于这些特殊情况，临床医生会评估是否需要延长检查周期或采用分子生物学检测等更敏感的方法。
建议出现呼吸道症状持续两周以上者规范完成结核病筛查流程。保持室内通风换气，加强营养摄入优质蛋白和维生素，避免随地吐痰。密切接触者应进行结核菌素皮肤试验筛查，学生及医务人员等高风险人群可定期做胸部X线检查。若后续检查仍无法确诊但症状持续存在，需考虑非结核分枝杆菌感染或其他肺部疾病可能。