红霉素眼膏与金霉素眼膏的主要区别在于成分、抗菌谱及适应证不同，红霉素眼膏适用于细菌性结膜炎等革兰阳性菌感染，金霉素眼膏对沙眼衣原体感染更有效。
1、成分差异
红霉素眼膏主要成分为大环内酯类抗生素红霉素，通过抑制细菌蛋白质合成发挥作用。金霉素眼膏则属于四环素类抗生素，其成分金霉素可干扰病原体核糖体功能。两者化学结构不同导致抗菌机制存在差异。
2、抗菌范围
红霉素对葡萄球菌、链球菌等革兰阳性菌效果显著，对支原体也有抑制作用。金霉素除覆盖部分革兰阳性菌外，对沙眼衣原体、立克次体等病原体具有特异性杀灭作用，是治疗沙眼的优选药物。
3、适应证区别
红霉素眼膏常用于细菌性结膜炎、睑缘炎等浅表感染。金霉素眼膏除治疗细菌性结膜炎外，被世界卫生组织列为沙眼防治核心药物，对包涵体性结膜炎也有明确疗效。
4、耐药性特点
长期使用金霉素可能诱导耐药菌株产生，部分地区的沙眼衣原体已出现四环素类耐药。红霉素耐药问题主要集中在葡萄球菌，但新型大环内酯类药物仍能保持敏感性。
5、使用注意事项
金霉素眼膏可能引起牙齿着色，儿童使用时需谨慎。红霉素眼膏偶见局部刺激反应，过敏者禁用。两者均需避免与乳制品同服，使用期间出现视力变化应立即停用。
使用眼膏前应清洁双手，避免管口接触眼部。细菌性感染通常需要连续使用5-7天，沙眼治疗需遵医嘱延长疗程。出现眼睑肿胀、视物模糊等异常应及时就医，不建议自行交替使用两种眼膏。保存时应置于阴凉干燥处，开封后超过四周不宜继续使用。