咽峡炎患者在退烧后仍可能具有传染性。疱疹性咽峡炎主要由肠道病毒引起，病毒可通过呼吸道飞沫、接触传播等方式传染他人，传染期通常持续1-2周，与是否发热无直接关联。
退热仅代表机体免疫系统初步控制感染，但口腔疱疹尚未完全愈合时，病毒仍可能存在于唾液、疱液中。患者咳嗽、打喷嚏或共用餐具时，病毒可能通过飞沫传播给他人。儿童患者恢复期频繁抓挠口腔疱疹后再接触玩具或其他物品，也可能造成间接传播。
免疫功能低下者或婴幼儿可能携带病毒更长时间。部分肠道病毒排出期可达3-4周，早产儿、先天性免疫缺陷患儿需特别警惕。若患者合并手足口病，粪便中的病毒排出时间可能延长至数周。
建议患者退烧后继续隔离至口腔疱疹完全结痂，一般需要7-10天。居家护理时需单独使用餐具并每日煮沸消毒，接触患儿分泌物后需用含氯消毒剂洗手。幼儿园等集体机构需严格执行晨检制度，发现新病例应及时采取隔离措施。恢复期可适量饮用常温流食，避免刺激性食物加重口腔黏膜损伤。