流感病毒感染后可能再次复发，但多数情况下不会在短时间内重复感染同一亚型病毒。流感病毒具有多种亚型且易变异，感染后产生的免疫力通常仅针对特定亚型，因此可能因接触新亚型病毒而再次发病。
流感病毒分为甲型、乙型和丙型，其中甲型流感病毒变异频率较高。人体感染某一亚型病毒后，免疫系统会产生针对该亚型的抗体，但若病毒发生抗原漂移或抗原转换，原有抗体可能无法有效识别新变异的病毒株。此外，不同亚型流感病毒之间缺乏交叉免疫保护，例如感染过H1N1病毒的人群仍可能感染H3N2病毒。免疫功能低下者更易出现重复感染，因其抗体生成能力较弱，保护持续时间较短。
极少数情况下，免疫系统异常或病毒变异程度极低时，可能发生同一亚型病毒的再感染。这种情况多见于未接种疫苗的老年人群、慢性病患者或接受免疫抑制治疗者。病毒在宿主体内长期潜伏后重新激活也可能导致临床症状复发，但这种现象在流感中较为罕见。
建议每年接种流感疫苗以预防不同亚型病毒感染，疫苗成分会根据世界卫生组织推荐的流行毒株进行更新。日常需保持室内通风、勤洗手、避免接触呼吸道感染患者。若出现反复发热、肌肉酸痛等流感样症状，应及时就医进行病原学检测，明确是否为不同病毒株感染或合并其他病原体感染。