新生儿三尖瓣关闭不全部分情况可能自然愈合，部分需医疗干预控制。三尖瓣关闭不全可能与先天性发育异常、肺动脉高压等因素有关，可通过定期随访、药物控制、手术治疗等方式管理。
轻度三尖瓣关闭不全的新生儿可能随生长发育逐渐改善。心脏结构轻微异常时，瓣膜功能可能随心肌成熟和血流动力学稳定而自行恢复。此类患儿通常仅需每3-6个月进行心脏超声复查，观察有无肺动脉压力升高或右心室扩大。日常需避免剧烈哭闹，母乳喂养时注意控制单次奶量防止呛咳，保持适宜环境温度减少心脏负荷。若伴随卵圆孔未闭等简单先心病，多数在1-2岁内闭合后瓣膜反流可减轻。
中重度病例需积极干预防止心力衰竭。当反流速度超过3米/秒或右心室持续扩大时，可能需使用地高辛口服溶液增强心肌收缩力，呋塞米片减轻体液潴留。肺动脉高压诱发者需持续低流量吸氧，必要时静脉滴注前列环素类药物。对于瓣膜发育严重畸形者，可在3-6月龄后考虑瓣膜成形术，使用Gore-Tex人工血管环加固瓣环。极少数瓣叶缺损者需进行生物瓣置换，但需待患儿体重超过8公斤方可实施。
新生儿三尖瓣关闭不全的长期管理需多学科协作。定期监测生长发育曲线，评估喂养效率与血氧饱和度。避免呼吸道感染诱发肺动脉压力波动，接种疫苗时优先选择灭活疫苗。哺乳期母亲应保证优质蛋白和维生素K摄入，有助于凝血功能稳定。若出现吃奶中断、多汗或生长迟缓等表现，需立即复查心脏超声调整治疗方案。