三防漆通常含有一定毒性，可能对人体带来危害。三防漆主要用于电子元器件的防护，其成分可能包括环氧树脂、聚氨酯、丙烯酸等化学物质，接触或吸入可能引发皮肤刺激、呼吸道不适等症状。
三防漆在固化前挥发性较强，施工过程中可能释放有害气体。直接接触未固化的三防漆可能导致皮肤红肿、瘙痒等过敏反应，长期吸入挥发性有机物可能引发头晕、恶心等不适。部分三防漆含有异氰酸酯类物质，可能诱发哮喘或过敏性肺炎。固化后的三防漆毒性显著降低，但机械加工时产生的粉尘仍可能刺激呼吸道。
特殊情况下，劣质三防漆可能含有超标重金属或禁用溶剂，长期接触可能损害肝脏或神经系统。部分敏感人群即使接触微量未固化漆料也可能出现严重过敏反应。电子维修人员若未佩戴防护装备反复接触三防漆，可能出现慢性职业性健康损害。
使用三防漆时应确保环境通风良好，佩戴防护手套和口罩，避免皮肤直接接触。施工后及时清洁工具和工作区域，固化前避免密闭空间长时间停留。出现持续咳嗽、皮疹等症状应及时就医，携带产品安全数据表供医生参考。电子爱好者进行小规模作业时建议选择水性环保型三防漆，并控制单次使用量。