复杂性肛瘘的检查方法主要有肛门指检、肛门镜检查、磁共振成像、肛管超声检查、瘘管造影等。复杂性肛瘘通常由肛周脓肿破溃后形成，可能伴随肛门疼痛、分泌物增多等症状。
1、肛门指检
肛门指检是初步筛查复杂性肛瘘的重要手段，医生通过戴手套的手指伸入肛门触诊，可判断瘘管走向、内口位置及周围组织硬度。检查时患者需采取侧卧位或膝胸位，若触及条索状硬结或按压有脓液溢出，往往提示瘘管存在。该检查无须特殊准备，但可能引起轻微不适。
2、肛门镜检查
肛门镜能直观观察肛管齿状线附近的内口位置，配合探针探查可明确瘘管分支情况。检查前需清洁灌肠，镜检时可见内口呈凹陷或红肿，严重者可见脓性分泌物。对于高位复杂性肛瘘，肛门镜可能无法完全显示瘘管全貌，需结合影像学检查。
3、磁共振成像
磁共振成像对软组织分辨率高，能清晰显示瘘管与肛门括约肌的立体关系，尤其适用于马蹄形瘘或高位复杂性肛瘘。检查前无须禁食，但需去除金属物品。三维重建图像可帮助医生规划手术路径，避免术中损伤括约肌导致肛门失禁。
4、肛管超声检查
肛管超声通过高频探头识别瘘管壁的层次结构，能区分单纯性瘘与复杂性瘘。检查时将探头置入肛管，无辐射且操作简便，可动态观察瘘管与括约肌的毗邻关系。超声引导下穿刺抽脓还能辅助诊断合并的肛周脓肿。
5、瘘管造影
瘘管造影通过向瘘管外口注入造影剂后拍摄X线片，能显示瘘管走向及分支情况。检查前需清洁瘘管，造影剂可能引发短暂胀痛。该方法对碘过敏者禁用，且不适用于急性感染期，目前已逐渐被磁共振替代。
确诊复杂性肛瘘后应避免久坐久站，每日用温水坐浴促进局部血液循环。饮食需增加膳食纤维摄入，如燕麦、西蓝花等，减少辛辣刺激食物。术后患者需定期复查，观察创面愈合情况，防止假性愈合或复发。出现发热、剧烈疼痛等症状时须及时就医。