睾丸炎和附睾炎的治疗方法不完全相同，需根据具体病因和病情制定方案。睾丸炎和附睾炎均可由细菌感染、病毒感染或外伤等因素引起，但治疗侧重点存在差异。
细菌性睾丸炎通常需使用抗生素如左氧氟沙星片、头孢克肟分散片等控制感染，配合卧床休息和阴囊托高减轻肿胀。附睾炎若由淋球菌或衣原体感染导致，可能需多西环素片联合头孢曲松钠注射治疗，急性期还需冰敷缓解疼痛。两种疾病均需避免剧烈运动，但附睾炎更强调解除尿路梗阻等诱因。病毒性睾丸炎如流行性腮腺炎继发者以对症治疗为主，而附睾炎较少由病毒直接引起。
慢性附睾炎可能需局部理疗或手术切除病灶，睾丸炎极少需要手术干预。两种疾病合并发生时，治疗需兼顾抗菌谱覆盖和器官功能维护，例如同时存在大肠杆菌感染时，选用对两种组织均有效的喹诺酮类药物。
日常应保持会阴清洁干燥，避免久坐和过度性生活。若出现发热、阴囊持续胀痛或排尿困难，须及时就医调整治疗方案，不可自行更换药物。