疱疹性咽峡炎不是手足口病，两者是两种不同的疾病，主要区别在于病原体、症状表现、并发症和传染性四个方面。
1、病原体不同
疱疹性咽峡炎主要由柯萨奇病毒A组引起，少数由肠道病毒71型或其他肠道病毒导致。手足口病则由多种肠道病毒引起，包括柯萨奇病毒A16型和肠道病毒71型等。虽然两者病原体存在部分重叠，但病毒亚型和致病特点有明显差异。
2、症状表现不同
疱疹性咽峡炎主要表现为咽部充血和口腔后部出现灰白色疱疹，可伴有高热、咽痛和食欲下降。手足口病除口腔疱疹外，还会在手掌、足底、臀部等部位出现皮疹，部分患者可能出现低热或中度发热，口腔疱疹多位于舌、颊黏膜等前部位置。
3、并发症不同
疱疹性咽峡炎并发症相对较少，可能出现脱水或继发细菌感染。手足口病可能出现神经系统并发症如脑炎、脑膜炎，严重者可导致肺水肿或循环衰竭，肠道病毒71型感染时神经系统并发症风险较高。
4、传染性不同
疱疹性咽峡炎主要通过飞沫传播和粪口途径传播，传染期相对较短。手足口病传播途径更广，除飞沫和粪口传播外，还可通过接触疱疹液传播，传染期较长，病毒在粪便中可存活数周。
疱疹性咽峡炎和手足口病均需注意隔离防护，患病期间应保持口腔清洁，选择温凉流质饮食，避免刺激性食物。密切观察病情变化，如出现持续高热、精神差、肢体抖动等症状应及时就医。日常需加强手卫生，对患儿用品进行消毒，在流行季节避免前往人群密集场所。