颅内生殖细胞肿瘤预后情况可分为低风险组、中风险组和高风险组三类，主要依据肿瘤病理类型、分期、治疗反应及生物标志物等因素综合评估。
低风险组通常包含纯生殖细胞瘤且对放疗敏感的患者，肿瘤体积较小且未发生转移，血清或脑脊液中甲胎蛋白和人绒毛膜促性腺激素水平正常。这类患者接受规范放疗后五年生存率较高，复发概率低，部分病例可能通过放疗联合化疗实现长期无进展生存。中风险组涵盖混合型生殖细胞肿瘤或伴有轻度升高的肿瘤标志物患者，肿瘤可能局部侵犯周围结构但未广泛转移。治疗方案需结合手术减瘤、放疗及多药联合化疗，治疗后需密切监测标志物变化和影像学复查，部分患者可能出现局部复发或远期内分泌功能障碍。高风险组包括非生殖细胞瘤性恶性生殖细胞肿瘤或伴有显著标志物升高的转移性病例，肿瘤常侵犯丘脑、基底节等深部结构或发生脊髓播散。即使采用高强度放化疗及自体干细胞移植等综合治疗，仍易出现耐药或早期复发，生存率相对较低。
所有患者在治疗后均需终身随访，定期进行神经影像学、内分泌功能及肿瘤标志物检测。康复期应关注认知功能保护与激素替代治疗，避免剧烈运动以防止颅内压波动，出现头痛、呕吐或视力变化等症状时需立即就医。饮食需保证充足优质蛋白和维生素摄入，减少高糖高脂食物以维持代谢平衡。