胎儿多囊肾能否自行改善取决于具体类型和病情严重程度。单纯性肾囊肿可能随胎儿发育逐渐缓解，而遗传性多囊肾病通常无法自愈。
单纯性肾囊肿多为单侧、孤立性病变，与发育异常或尿路梗阻有关。部分胎儿在妊娠中后期囊肿可能缩小或消失，尤其当囊肿体积较小且未压迫周围器官时。孕期超声监测可观察到囊肿动态变化，若未合并肾积水或其他畸形，出生后肾功能多不受影响。这类情况无需特殊干预，但需定期复查超声评估进展。
遗传性多囊肾病如常染色体隐性多囊肾属于进行性加重的先天畸形，肾脏会逐渐被无数囊肿取代。胎儿期即可出现双肾增大伴皮质回声增强，羊水过少是典型伴随症状。此类病变不可逆转，严重者可能导致新生儿呼吸衰竭或肾功能不全，需通过产前基因检测明确诊断。出生后需多学科协作管理，必要时进行透析或肾移植。
建议孕妇在发现胎儿肾囊肿后完善染色体检查及针对性超声评估，动态监测囊肿变化与羊水量。出生后应定期检查尿常规、肾功能及肾脏超声，避免剧烈运动防止囊肿破裂。哺乳期母亲需保持低盐饮食，婴幼儿喂养应咨询临床营养师制定个性化方案。