口腔尖锐湿疣容易与口腔扁平苔藓、口腔白斑、口腔乳头状瘤、口腔鳞状细胞癌、口腔念珠菌病等疾病混淆。口腔尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起的黏膜疣状病变，需通过病理检查明确诊断。
1、口腔扁平苔藓
口腔扁平苔藓表现为黏膜白色网状或斑块状病变，可能与免疫异常有关，通常伴有灼痛感。临床需与尖锐湿疣的乳头状增生区分，可通过醋酸白试验或活检鉴别。治疗可遵医嘱使用曲安奈德口腔软膏、复方氯己定含漱液等药物，必要时采用激光治疗。
2、口腔白斑
口腔白斑为黏膜白色角化斑块，多与吸烟、咀嚼槟榔等刺激相关，存在癌变风险。其表面平坦或粗糙，易与尖锐湿疣的菜花样外观混淆。确诊需病理检查，治疗包括消除刺激因素，使用维A酸乳膏，严重时手术切除。
3、口腔乳头状瘤
口腔乳头状瘤是良性上皮增生，表面呈指状突起，与HPV低危型感染相关。病变单发且边界清晰，需与尖锐湿疣的多发性和传染性区别。治疗以手术切除为主，可配合干扰素凝胶预防复发。
4、口腔鳞状细胞癌
口腔鳞癌表现为溃疡或菜花样肿物，进展迅速伴浸润生长，与长期HPV感染或烟草使用有关。需通过活检与尖锐湿疣鉴别，治疗需手术、放疗等综合措施，早期发现预后较好。
5、口腔念珠菌病
口腔念珠菌病常见白色伪膜或红斑，伴口干、灼痛，多见于免疫力低下者。与尖锐湿疣的疣体形态差异明显，但糜烂型可能误诊。治疗采用制霉菌素含漱液、氟康唑胶囊等抗真菌药物，同时改善口腔卫生。
口腔尖锐湿疣患者应避免与他人共用餐具，保持口腔清洁，定期复查以监测病情变化。若发现黏膜异常增生或久治不愈的病变，需及时就医进行病理学检查，明确诊断后针对性治疗。日常注意增强免疫力，减少吸烟饮酒等刺激因素。