慢性肠胃炎需要与肠易激综合征、炎症性肠病、肠结核、肠道肿瘤、乳糜泻等疾病相鉴别。这些疾病症状相似，但病因和治疗方案不同，需通过病史、实验室检查及影像学检查明确诊断。
1、肠易激综合征
肠易激综合征主要表现为腹痛、腹胀及排便习惯改变，但无器质性病变。与慢性肠胃炎不同，肠易激综合征症状常与情绪、压力相关，肠镜检查无异常。治疗以调整饮食、缓解压力为主，必要时可遵医嘱使用马来酸曲美布汀片、复方谷氨酰胺肠溶胶囊或匹维溴铵片等药物调节胃肠功能。
2、炎症性肠病
炎症性肠病包括克罗恩病和溃疡性结肠炎，属于自身免疫性疾病，表现为反复腹痛、腹泻、血便等。与慢性肠胃炎相比，炎症性肠病病程更长，可能伴随发热、体重下降。肠镜检查可见黏膜溃疡或增生。治疗需遵医嘱使用美沙拉嗪肠溶片、醋酸泼尼松片或英夫利西单抗注射液等药物控制炎症。
3、肠结核
肠结核由结核分枝杆菌感染引起，症状包括长期低热、盗汗、腹痛及腹泻。与慢性肠胃炎不同，肠结核患者多有肺结核病史，结核菌素试验阳性。治疗需规范抗结核治疗，如遵医嘱使用异烟肼片、利福平胶囊或吡嗪酰胺片等药物，疗程较长。
4、肠道肿瘤
肠道肿瘤早期症状与慢性肠胃炎相似，但可能伴随消瘦、贫血、便血等警示症状。肠镜检查可发现占位性病变，病理活检确诊。治疗需根据肿瘤性质选择手术切除、化疗或放疗，如卡培他滨片、奥沙利铂注射液等药物可能用于术后辅助治疗。
5、乳糜泻
乳糜泻是麸质不耐受导致的自身免疫性疾病，表现为腹泻、腹胀及营养不良。与慢性肠胃炎不同，乳糜泻患者摄入麸质后症状加重，血清学检查可见特异性抗体升高。治疗需严格无麸质饮食，必要时补充维生素D滴剂、葡萄糖酸钙锌口服溶液等营养素。
慢性肠胃炎患者需注意饮食清淡，避免辛辣刺激及生冷食物，规律进食，减少胃肠负担。适当补充益生菌如双歧杆菌三联活菌散有助于调节肠道菌群。若症状持续不缓解或出现体重下降、便血等异常表现，应及时就医完善肠镜、粪便检查等明确诊断，避免延误其他疾病的治疗时机。