肛瘘手术过程中需注意术前准备、术中配合及术后护理，主要有麻醉方式选择、手术方式选择、术中体位调整、创面处理、术后换药等事项。手术方式包括肛瘘切开术、肛瘘切除术等，需根据瘘管位置和复杂程度决定。
术前需完善相关检查，排除手术禁忌，医生会根据病情选择局部麻醉或全身麻醉。术中患者需保持稳定体位，避免随意移动影响手术操作。医生会彻底清除瘘管及周围坏死组织，处理内口防止复发，同时尽可能保护肛门括约肌功能。创面处理需严格止血，必要时放置引流条。术后需定期换药，保持创面清洁干燥，观察有无出血、感染等并发症。
肛瘘术后应保持清淡饮食，避免辛辣刺激食物，多摄入富含膳食纤维的蔬菜水果预防便秘。术后1-2天可适当活动，但避免剧烈运动。排便后需及时清洁会阴部，按医嘱使用高锰酸钾溶液坐浴。出现发热、剧烈疼痛、大量渗血等情况需及时就医。术后恢复期间应避免久坐久站，定期复查评估愈合情况。