肠镜主要分为普通肠镜和无痛肠镜两种类型。普通肠镜是在患者清醒状态下进行的检查，无痛肠镜则通过静脉麻醉使患者在无意识状态下完成检查。
普通肠镜采用纤维结肠镜或电子结肠镜，经肛门进入肠道观察结肠黏膜病变，适用于便血、慢性腹泻、肠息肉筛查等常规检查。检查前需严格清洁肠道，过程中患者可能感到腹胀或轻微疼痛，但多数可以耐受。医生可通过活检钳取样或直接切除小型息肉。检查后可能出现短暂腹胀，建议2小时后进食流质食物。
无痛肠镜在麻醉医师监护下进行，使用丙泊酚等短效静脉麻醉药物，使患者在睡眠状态下完成检查。特别适合对疼痛敏感、有肛门括约肌痉挛或需要复杂治疗操作的患者。检查前同样需要肠道准备，且要求术前禁食6小时以上。术后需监测生命体征至完全清醒，24小时内禁止驾驶和高空作业。两种肠镜的检查范围和诊断准确性相同，主要区别在于舒适度和麻醉风险。
肠镜检查后应保持清淡饮食1-2天，避免辛辣刺激食物。适当补充益生菌有助于恢复肠道菌群平衡。若出现持续腹痛、发热或便血需及时就医。建议40岁以上人群每5-10年进行一次肠镜筛查，有家族史者应提前至35岁开始定期检查。