手足口病后遗症主要有心肌炎和神经系统损伤。手足口病通常由肠道病毒感染引起，多数患者预后良好，但少数可能出现严重并发症。
1、心肌炎
手足口病并发心肌炎可能与柯萨奇病毒A16型或肠道病毒71型感染有关，病毒直接侵犯心肌细胞导致炎症反应。患者可能出现心悸、胸闷、乏力等症状，严重时伴随心律失常或心力衰竭。临床常用磷酸肌酸钠注射液、辅酶Q10片、维生素C注射液等药物辅助治疗。急性期绝对卧床休息，限制体力活动，必要时需心电监护。
2、神经系统损伤
重症手足口病可能引发脑干脑炎或无菌性脑膜炎，与病毒突破血脑屏障有关。典型表现包括持续高热、肢体抖动、嗜睡甚至抽搐，部分患儿遗留运动障碍或认知功能受损。治疗需使用甘露醇注射液降低颅内压，人免疫球蛋白中和病毒，甲泼尼龙琥珀酸钠控制炎症。恢复期需配合康复训练改善神经功能与运动协调性。
手足口病康复后应定期监测心电图和神经系统评估，避免剧烈运动1-2个月。饮食选择易消化富含优质蛋白的食物如鱼肉、蒸蛋，适量补充维生素B族营养神经。保持充足睡眠，注意观察有无异常疲劳或行为改变，出现肢体无力、步态不稳等症状需及时复查脑部影像学检查。