更昔洛韦和阿昔洛韦均为抗病毒药物，但两者在适应证、作用机制及不良反应等方面存在差异。更昔洛韦主要用于巨细胞病毒感染，阿昔洛韦则适用于单纯疱疹病毒及水痘-带状疱疹病毒感染。
1、适应证差异
更昔洛韦的适应证为免疫缺陷患者并发的巨细胞病毒感染，如巨细胞病毒视网膜炎、肺炎或胃肠炎。阿昔洛韦主要用于治疗单纯疱疹病毒引起的皮肤黏膜感染、生殖器疱疹，以及水痘-带状疱疹病毒感染。两者针对的病毒类型不同，临床不可互相替代。
2、作用机制区别
更昔洛韦通过抑制病毒DNA聚合酶终止巨细胞病毒DNA链延伸，需经病毒激酶磷酸化激活。阿昔洛韦同样依赖病毒胸苷激酶磷酸化，但选择性更强，对宿主细胞毒性更低。更昔洛韦对巨细胞病毒DNA聚合酶的亲和力显著高于阿昔洛韦。
3、药代动力学特点
更昔洛韦口服生物利用度较低，通常需静脉给药，脑脊液渗透率约24%-70%。阿昔洛韦口服吸收较差，但局部外用制剂生物利用度较高，脑脊液渗透率为血浆浓度的50%。两者均通过肾脏排泄，肾功能不全时需调整剂量。
4、不良反应对比
更昔洛韦常见骨髓抑制如中性粒细胞减少、血小板减少，可能引发肾功能损害。阿昔洛韦不良反应以头痛、恶心等胃肠道症状为主，偶见可逆性肾功能异常。更昔洛韦的骨髓毒性使其需严格监测血常规。
5、特殊人群用药
更昔洛韦妊娠期禁用，哺乳期需暂停喂养。阿昔洛韦妊娠期安全性数据相对较多，但仍需权衡利弊。儿童使用更昔洛韦需根据体表面积调整剂量，阿昔洛韦儿童用药需谨慎评估肝肾功能。
使用抗病毒药物前需完善病原学检测明确感染类型，避免盲目用药。治疗期间应定期监测血常规、肝肾功能等指标，出现骨髓抑制或肾功能异常需及时就医。两种药物均需在医生指导下规范使用，不可自行调整剂量或疗程。