扁桃体手术后可能出现咽部疼痛、出血、感染等后遗症，多数症状可逐渐缓解。扁桃体切除术主要用于治疗反复扁桃体炎或阻塞性睡眠呼吸暂停，术后护理对减少后遗症至关重要。
术后1-3天内咽部疼痛较明显，可能放射至耳部，影响吞咽和进食。疼痛程度因人而异，儿童耐受性通常较差。创面白膜形成期间可能出现口臭，属于正常愈合过程。少量渗血常见于术后24小时内，若出血量超过5毫升或呈鲜红色需紧急处理。术后1-2周内需警惕继发性出血风险，多因白膜脱落或剧烈咳嗽导致。感染发生率较低，表现为持续高热、创面脓性分泌物或颈部淋巴结肿痛。
极少数情况下可能出现麻醉相关并发症如恶心呕吐，或术后鼻咽返流、味觉改变等神经暂时性损伤。瘢痕体质患者可能出现咽部瘢痕挛缩导致异物感。长期随访数据显示，成人术后可能出现咽干症状，儿童术后免疫代偿功能通常不受影响。
术后应保持口腔清洁，使用生理盐水漱口，避免剧烈运动2周。饮食从流质逐步过渡到软食，避免过热、辛辣及坚硬食物。出现持续发热、大量出血或呼吸困难需立即就医。定期复查可评估创面愈合情况，多数后遗症在1个月内逐渐消失。