茵陈具有清热利湿、利胆退黄、保肝护肝等功效，主要用于黄疸、肝炎、胆囊炎等疾病的辅助治疗。
1、清热利湿
茵陈性微寒，归脾、胃、肝、胆经，能有效清除体内湿热。湿热蕴结引起的皮肤发黄、小便短赤、舌苔黄腻等症状，可用茵陈配伍栀子、大黄等药材煎服。现代研究表明其含有的绿原酸、咖啡酸等成分能促进胆汁分泌，帮助代谢湿热毒素。
2、利胆退黄
茵陈是治疗黄疸的要药，对肝胆湿热型黄疸效果显著。其有效成分茵陈蒿素能增强肝细胞对胆红素的摄取和排泄能力，降低血清胆红素水平。临床常与金钱草、虎杖等组成复方，用于新生儿黄疸、梗阻性黄疸等病症。
3、保肝护肝
茵陈中的黄酮类物质能抑制肝细胞脂质过氧化，减轻酒精、药物等因素导致的肝损伤。动物实验显示其提取物可降低转氨酶水平，改善肝纤维化。慢性肝炎患者可长期适量服用茵陈茶，但需避免与肝毒性药物同用。
4、抗炎抑菌
茵陈煎剂对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等常见致病菌有抑制作用，其挥发油成分能减轻胆囊壁炎症反应。急性胆囊炎发作期可用鲜茵陈捣敷右上腹，或配伍蒲公英、黄芩等清热解毒药内服。
5、调节免疫
茵陈多糖能激活巨噬细胞功能，调节Th1/Th2细胞平衡，对自身免疫性肝病有一定改善作用。体质虚弱者服用茵陈红枣汤可增强抵抗力，但自身免疫性疾病患者需在医生指导下使用。
使用茵陈时建议选择道地药材，阴凉干燥处保存。湿热体质者可每周饮用2-3次茵陈薏米粥，脾胃虚寒者应配伍生姜、大枣。出现药物过敏或腹泻需立即停用，孕妇慎用。治疗肝胆疾病需配合规范用药，不可单靠茵陈替代主治方案。