使用抗生素的危害主要包括诱发细菌耐药性、破坏肠道菌群平衡、引发过敏反应、导致肝肾损伤以及掩盖真实病情。抗生素滥用可能增加治疗难度，严重时威胁生命健康。
1、细菌耐药性
长期或过量使用抗生素会筛选出耐药菌株，导致常见抗生素失效。例如肺炎链球菌对青霉素耐药率逐年上升，可能使普通感染演变为难治性感染。耐药基因还可在不同细菌间传播，加剧公共卫生风险。
2、肠道菌群失衡
广谱抗生素会无差别杀灭肠道有益菌，引发腹泻、腹胀等不良反应。双歧杆菌等益生菌群被破坏后，可能增加艰难梭菌感染风险，严重时导致伪膜性肠炎。儿童使用抗生素后更易出现长期肠道功能紊乱。
3、过敏反应
青霉素类、头孢类抗生素可能引起皮疹、药物热等过敏表现。严重时可发生过敏性休克，表现为喉头水肿、血压骤降，需立即使用肾上腺素注射液抢救。有过敏史者使用前必须进行皮试。
4、肝肾毒性
氨基糖苷类抗生素如硫酸庆大霉素注射液具有肾毒性，可能引发蛋白尿或急性肾损伤。四环素类抗生素如盐酸多西环素片经肝脏代谢，肝功能异常者使用可能加重肝损伤。长期用药需定期监测肝肾功能。
5、掩盖病情
未经明确诊断滥用抗生素可能抑制部分病原体生长，干扰血培养等检查结果。如结核病患者误用抗生素后，可能延误肺结核的诊断，导致病灶扩散。发热患者盲目使用抗生素还会影响对疾病进展的判断。
使用抗生素应严格遵循医嘱，完成规定疗程避免自行减药。用药期间注意补充益生菌制剂如双歧杆菌三联活菌胶囊，维持肠道微生态平衡。出现严重腹泻、皮疹或尿量减少时应立即就医。普通感冒等病毒性感染无须使用抗生素，日常通过勤洗手、接种疫苗等方式可减少抗生素使用需求。