肛门畸形的引起是由于胚胎发育期间肛门和泌尿道之间的障碍发生了错误。在正常情况下，肛门和尿道是通过不同的通道开口到体外，但在某些情况下，胚胎发育过程中的异常导致两者之间的连接出现问题，从而导致肛门畸形的出现。
肛门畸形可以分为两种类型：上端肛门畸形和下端肛门畸形。上端肛门畸形通常指肛门口的位置异常，比如肛门口位于会阴部、尿道开口、阴茎上方等位置。下端肛门畸形则是指肛门口开口处异常，例如肛门口狭窄、未完全闭合等。
肛门畸形的发生可以由多种因素导致。遗传因素可能在肛门畸形的发生中起到一定作用。研究表明，某些家庭中肛门畸形的发生率相对较高，这表明遗传因素可能与该疾病的发生有一定关联。
环境因素也可能对肛门畸形的发生起到一定影响。母体在怀孕期间接触到一些有害物质，如毒素、放射线等，可能会增加胚胎发生肛门畸形的风险。孕妇在怀孕期间患有某些疾病，如糖尿病、甲状腺疾病等，也可能增加肛门畸形的发生风险。
胚胎发育过程中的某些基因突变或表达异常也被认为是肛门畸形的潜在原因之一。这些基因异常可能会导致肛门和泌尿道之间的障碍发生错误，从而引发肛门畸形。
肛门畸形的发生是多种因素综合作用的结果，包括遗传因素、环境因素以及胚胎发育过程中的基因异常。人们对这一领域的研究仍在进行中，希望通过进一步的探索和研究，找到更多导致肛门畸形的具体原因，并提供更好的预防和治疗手段。
