百日咳是由一种叫做百日咳杆菌Bordetella pertussis感染引起的呼吸道传染病。这种病菌通过飞沫传播，当被感染者咳嗽、打喷嚏或说话的时候，病菌会通过飞沫悬浮在空气中，然后被其他人吸入体内，引起感染。
百日咳的病菌进入人体后，会定位在呼吸道上部，主要包括鼻腔、喉咙和气管。病菌依附在上述部位的细胞表面并繁殖，释放出毒素，导致炎症和咳嗽症状。这种病毒主要通过黏膜上皮细胞表面的纤毛突破，进入细胞内部并繁殖，最终导致上皮细胞死亡。死亡的细胞和病菌残留物会引起免疫系统的激活，引发大量白细胞和炎症细胞的聚集，释放炎性介质，导致呼吸道炎症反应加剧。
百日咳的毒素会影响纤毛运动和上皮细胞功能，造成黏膜表面的纤毛运动减慢或无法正常工作。纤毛是呼吸道的重要机制之一，它们可以通过扫动动作将粘附在黏膜上的病菌和其他异物排出体外。因此，纤毛运动的受损导致了病菌在呼吸道上部滞留时间延长，从而加剧了炎症反应和咳嗽症状。
百日咳的传播方式多样，包括直接接触感染者的飞沫，经过近距离的呼吸空气传播，以及与感染者共用餐具、杯子等方式传播。由于百日咳细菌存在于感染者的呼吸道中，在感染后的一段时间内，即使感染者没有明显的症状，仍有可能传播给他人。因此，保持良好的个人卫生习惯、及时接种疫苗、避免与感染者密切接触是预防百日咳传播的重要措施。
