由于结石的性质、形态、大小、部位不同、患者个体差异等因素，导致结石治疗方法和疗效也不相同。

因此，对于肾结石的患者需要使用个体化的治疗，有时需要综合治疗。急性期的治疗，当出现肾绞痛和感染时，应该立即处理，感染的患者应及时应用抗生素治疗，必要时可行肾穿刺引流。肾结石患者轻度痛，可用非甾体类镇痛药物，配合解痉药物治疗，疼痛剧烈可注射哌替啶镇痛。双侧输管结石合并梗阻无尿的患者应立即行手术治疗。药物治疗，包括肾绞痛的治疗、非甾体类抗炎镇痛药物、阿片镇痛药、解痉药、排石治疗等。手术治疗包括体外冲击波碎石术、经皮肾镜碎石术、输尿管软镜碎石术、开放手术等。