百合和麦冬在药用功效、植物学特征及临床应用上存在明显差异。百合主要具有润肺止咳、清心安神等功效；麦冬则以养阴生津、润肺清心为主。
百合为百合科植物卷丹或细叶百合的干燥肉质鳞叶，性微寒味甘，归心肺经。其润肺止咳作用适用于阴虚燥咳、劳嗽咯血，清心安神功能可改善失眠多梦、精神恍惚。现代研究显示百合含秋水仙碱等生物碱，具有镇咳祛痰作用。临床常用百合固金汤治疗肺肾阴虚，或与知母配伍组成百合知母汤。
麦冬是百合科植物麦冬的干燥块根，性微寒味甘微苦，归心肺胃经。其养阴生津功效突出，适用于胃阴虚口渴、肠燥便秘，润肺清心作用可缓解肺燥干咳、心烦失眠。麦冬多糖是其主要活性成分，能增强免疫、降血糖。经典方剂如生脉散中用麦冬配伍人参五味子，益胃汤中与沙参玉竹同用。
日常使用需注意两者均属寒凉药材，脾胃虚寒者应慎用。鲜百合可做药膳如百合莲子羹，但需充分烹煮破坏秋水仙碱毒性；麦冬代茶饮时建议与枸杞配伍以中和寒性。建议在中医师指导下辨证使用，避免长期单味大量服用，服用期间忌食辛辣油腻。若出现腹胀腹泻等不适需及时停用，孕妇及儿童用药前应咨询专业医师。