毛蒿草具有清热解毒、祛风除湿、止血止痛等功效，主要用于治疗感冒发热、风湿痹痛、外伤出血等症状。
1、清热解毒
毛蒿草含有挥发油和黄酮类化合物，能抑制细菌和病毒生长，对风热感冒引起的咽喉肿痛、咳嗽痰黄有缓解作用。可与金银花、连翘等配伍增强效果。
2、祛风除湿
其活性成分能促进关节血液循环，减轻风湿性关节炎导致的关节肿胀疼痛。常与羌活、独活等药材同用，外敷或煎汤熏洗患处效果更佳。
3、止血止痛
鲜品捣烂外敷可快速收敛小血管，适用于皮肤擦伤、鼻衄等浅表出血。所含镇痛成分对跌打损伤引起的局部瘀痛有改善作用。
4、调节胃肠
煎剂内服能缓解湿热型腹泻，通过抑制肠道致病菌调节菌群平衡。脾胃虚寒者慎用。
5、驱虫杀虫
其特殊气味可驱避蚊虫，煎汁涂抹皮肤能预防虫咬皮炎。农业上可用于制作天然杀虫剂。
使用毛蒿草时建议咨询中医师辨证施治，孕妇及过敏体质者慎用。鲜品外用需清洁消毒避免感染，内服不宜过量。配合清淡饮食，避免辛辣刺激食物影响药效。储存时置于阴凉干燥处防止霉变。