茉莉花茶和绿茶在制作工艺、口感及功效上存在明显差异，茉莉花茶以绿茶为茶胚经茉莉花窨制而成，兼具绿茶与茉莉花香，具有舒缓情绪、促进消化等功效；绿茶未经发酵保留更多茶多酚，以抗氧化、提神醒脑为主要特点。
茉莉花茶通过将绿茶与鲜花反复窨制，使茶叶吸附茉莉挥发性成分，形成独特花香。其茶性温和，花香物质有助于缓解焦虑情绪，芳樟醇等成分可刺激消化液分泌，适合餐后饮用。但窨制过程会部分损失绿茶原有茶多酚，抗氧化能力略逊于绿茶。
绿茶采用高温杀青工艺抑制酶活性，最大限度保留儿茶素、维生素C等活性物质。表没食子儿茶素没食子酸酯具有强自由基清除能力，茶氨酸与咖啡因协同作用可改善注意力。但未发酵茶对胃肠刺激较大，空腹饮用可能引发不适。
日常饮用茉莉花茶建议选择午后或饭后，水温控制在90℃以下避免破坏花香成分，每日不超过800毫升；绿茶适宜上午饮用提升专注力，胃寒者可用85℃热水冲泡降低刺激性，避免与含铁食物同食影响吸收。两类茶均含咖啡因，孕妇及失眠人群应控制摄入量，长期存放需密封避光防潮以保持风味活性。