腰椎间盘突出微创治疗存在一定风险，但整体安全性较高。微创治疗方式主要有经皮椎间孔镜髓核摘除术、椎间盘镜下髓核摘除术、射频消融术、胶原酶溶解术、经皮激光椎间盘减压术等。
经皮椎间孔镜髓核摘除术通过建立微小通道摘除突出髓核，可能发生神经根损伤或硬膜囊撕裂。椎间盘镜下髓核摘除术需在椎间盘内操作，存在终板损伤或椎间隙感染风险。射频消融术利用高温使髓核变性收缩，操作不当可能造成周围组织热损伤。胶原酶溶解术通过注射酶制剂溶解髓核，可能引发过敏反应或神经毒性。经皮激光椎间盘减压术使用激光汽化部分髓核，能量控制不当可能导致椎体骨性结构损伤。
特殊情况下如严重椎管狭窄、椎体滑脱或马尾综合征患者，微创治疗风险会显著增加。高龄患者合并骨质疏松时，术中可能出现椎体骨折。凝血功能障碍者术后易发生硬膜外血肿。解剖变异患者术中定位困难可能加重神经损伤。既往腰椎手术史者因瘢痕粘连会增加操作难度和风险。
术后需严格卧床24-48小时，3个月内避免弯腰搬重物，加强腰背肌功能锻炼。选择有丰富经验的医疗机构和医生，术前完善影像学评估，术中采用神经监测技术，术后配合康复训练，可最大限度降低风险。日常保持正确坐姿，控制体重，避免久坐久站，睡眠选择硬板床，有助于预防疾病复发。