怀孕36天通常可以进行药物流产，但需在医生评估后决定。药物流产适用于妊娠49天内的宫内妊娠，需排除禁忌证并严格遵循医嘱。
药物流产通过米非司酮片和米索前列醇片联合使用终止妊娠。米非司酮片可拮抗孕激素，使胚胎组织坏死脱落，米索前列醇片促进子宫收缩排出妊娠物。用药前需经超声确认孕囊位置及大小，排除宫外孕。用药期间可能出现腹痛、阴道出血等反应，需在医疗机构观察4-6小时。完全流产率可达90%以上，但存在5%-10%概率需清宫术补救。流产后需复查超声确认妊娠物排净，两周内禁止盆浴及性生活。
药物流产禁用于肾上腺疾病、血液病、哮喘等患者，长期服用糖皮质激素或非甾体抗炎药者需调整用药方案。35岁以上吸烟女性需谨慎评估心血管风险。用药后出现发热、剧烈腹痛或出血量超过月经量2倍时应立即就医。流产后需关注月经恢复情况，异常出血或闭经需排查宫腔粘连等并发症。
流产后应卧床休息1-3天，避免重体力劳动两周。加强营养补充优质蛋白和铁元素，适量食用瘦肉、动物肝脏、深色蔬菜等。保持会阴清洁，每日用温水清洗外阴，勤换卫生巾。一个月内禁止游泳、泡温泉等可能引起感染的活动。恢复性生活后需采取可靠避孕措施，半年内避免再次妊娠。出现持续腹痛、异常分泌物或发热等症状需及时复诊。建议通过心理咨询缓解可能出现的情绪波动，必要时寻求专业心理支持。