土茯苓和茯苓是两种不同的中药材，虽然名称相似，但来源、功效和应用有显著差异。
1、来源不同
土茯苓为百合科植物光叶菝葜的干燥根茎，主产于长江流域以南地区。茯苓为多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核，多寄生于松树根部，云南、安徽等地为主要产区。两者植物基原完全不同，属于不同科属的药用部位。
2、性状差异
土茯苓呈不规则块状，表面黄棕色至灰褐色，质地坚硬断面类白色。茯苓则呈类球形或不规则块状，表面淡棕色至褐色，内部白色或淡红色，质地细腻。两者饮片形态和断面特征具有明显区别。
3、功效区别
土茯苓主要功效为解毒除湿、通利关节，常用于梅毒、汞中毒及湿热淋浊等症。茯苓则以利水渗湿、健脾宁心为主，适用于水肿尿少、脾虚食少、心神不安等症状。两者虽均有祛湿作用，但主治方向存在差异。
4、成分差异
土茯苓含落新妇苷、黄酮类等成分，具有抗炎、免疫调节作用。茯苓主要含茯苓多糖、三萜类化合物，以利尿、镇静效果著称。现代药理研究表明两者活性成分和作用机制各不相同。
5、应用禁忌
土茯苓肝肾阴虚者慎用，可能引起消化道不适。茯苓阴虚而无湿热者不宜，过量可能导致电解质紊乱。两者配伍禁忌也不同，土茯苓忌与茶同服，茯苓不宜与白蔹、地榆等中药同用。
使用中药材时应由中医师辨证施治，不可自行替换使用。土茯苓与茯苓在储存时需置阴凉干燥处，防止霉变。日常饮食中可搭配薏苡仁、赤小豆等增强祛湿效果，但需注意体质适宜性。出现药物不良反应应立即停用并就医。