输尿管镜取石术一般不会产生剧烈疼痛，术中会使用麻醉措施减轻不适感。术后可能出现轻微尿道刺痛或排尿不适，通常1-3天可缓解。
输尿管镜取石术属于微创手术，术前会通过腰麻或全麻使患者进入无痛状态。术中医生将纤细的输尿管镜经尿道自然腔道进入输尿管，利用激光或套石篮粉碎并取出结石，整个过程不会造成皮肤切口。由于输尿管黏膜神经分布较少，且麻醉效果良好，多数患者仅感觉下腹部轻微胀感，无明显痛觉。术后麻醉消退后可能出现尿道刺激症状，如排尿时灼热感或尿频，这与器械通过尿道造成的短暂黏膜充血有关，通常24-48小时内自行消失。部分患者因结石位置特殊需留置双J管，可能引起腰部酸胀或血尿，这些症状会随导管拔除而消失。
极少数情况下，若患者存在输尿管狭窄、结石嵌顿时间较长或合并感染，术中可能出现输尿管黏膜损伤导致术后疼痛加剧。既往有慢性盆腔疼痛综合征或膀胱过度活动症的患者，术后排尿不适感可能更明显。这类情况需及时告知医生，可通过调整导管位置、使用解痉药物或低频电刺激等方式改善症状。
术后建议多饮水保持每日尿量2000毫升以上，有助于冲刷尿道残留碎石。避免剧烈运动及重体力劳动1-2周，减少导管移位风险。出现持续发热、肉眼血尿加重或腰痛不缓解时需及时复诊。饮食上限制高草酸食物如菠菜、浓茶，适量补充柑橘类水果预防结石复发。