肛瘘手术一般需要2-4周恢复，实际时间受到手术方式、创面大小、术后护理、个体差异等多种因素的影响。
1、手术方式
单纯性肛瘘采用瘘管切开术恢复较快，复杂性肛瘘需挂线疗法或皮瓣移植，愈合时间延长。
2、创面大小
瘘管分支少且位置浅表者创面较小，深部瘘管或合并脓肿清除者需更长时间组织修复。
3、术后护理
规范换药和坐浴可促进愈合，若发生伤口感染或排便刺激会导致恢复期延长。
4、个体差异
糖尿病患者或免疫力低下人群愈合速度较慢，青少年恢复通常快于中老年患者。
术后应保持肛门清洁干燥，避免久坐久站，遵医嘱使用高锰酸钾坐浴，饮食需增加膳食纤维预防便秘。