手术后颌骨囊肿的囊腔空腔的处理方法应视情况而定。
第一、一般囊肿较小、中等大小的囊肿，在手术后囊壁清除后，一般颌骨囊肿囊腔里面不会是空的，它会有血液在里面沉积，血液沉积后慢慢的凝固，凝固后会慢慢钙化，钙化后一般三到六个月会成骨，就是在门诊拍片复查后，囊腔里会有钙化，从低密度影黑色慢慢会变成灰白色，最后变成骨性白色；
第二、较大的囊腔做完手术后也会成骨，但成骨较困难，成骨不全，这时可用人工骨植入，如羟基磷灰石，在人工骨植入后，这样对成骨会有好处，如有牙缺失，人工骨植入后对成骨有好处，对以后的修复、缺失牙的修复，如植牙也是有好处的。