生鸡蛋一般不建议直接食用，可能存在细菌感染风险。鸡蛋在未充分加热的情况下可能携带沙门氏菌等致病微生物，可能引起胃肠不适或食物中毒。
鸡蛋在生食状态下蛋白质吸收率较低，生物利用率仅为50％左右，而煮熟后可达90％以上。生鸡蛋中含有抗生物素蛋白，这种物质会阻碍生物素的吸收，长期食用可能影响皮肤和神经系统健康。生鸡蛋的质地和口感也较差，可能引起恶心等不适反应。
部分特殊饮食方式如某些沙拉酱、提拉米苏等甜品会使用经过巴氏消毒的液态蛋制品，这类产品经过专业杀菌处理，致病菌数量控制在安全范围内。运动员或健身人群有时会饮用生鸡蛋补充蛋白质，但需要选择经过严格检疫的蛋品，并控制摄入频率。
建议将鸡蛋加热至蛋黄和蛋白完全凝固后食用，这样既能保证食品安全又能提高营养吸收率。储存鸡蛋时应放置于冰箱冷藏室，烹饪前需清洁蛋壳表面。老年人、孕妇、婴幼儿及免疫力低下人群更应避免食用生鸡蛋，出现腹泻、发热等食物中毒症状需及时就医。
