生鸡蛋并不比熟鸡蛋更有营养，熟鸡蛋的营养吸收率更高且安全性更好。生鸡蛋可能含有沙门氏菌等致病微生物，加热过程能有效杀灭病原体，同时使蛋白质变性更易被人体消化吸收。
鸡蛋加热后蛋白质空间结构展开，蛋白酶更容易分解蛋白质为氨基酸。熟鸡蛋的蛋白质消化吸收率可达90％以上，而生鸡蛋仅约50％。蛋黄中的生物素结合蛋白在加热后失去活性，避免影响生物素吸收。煮熟的鸡蛋还能提高铁元素的生物利用率，卵黄高磷蛋白热变性后减少对铁吸收的干扰。维生素B2、维生素B5等热稳定性较好的营养素在加热过程中损失有限。
生鸡蛋清中含有抗胰蛋白酶和抗生物素蛋白，前者会抑制蛋白质消化，后者阻碍生物素吸收。沙门氏菌污染是生食鸡蛋的主要风险，可能引发发热、腹泻等食源性疾病。禽类粪便中的病菌可通过蛋壳气孔侵入，巴氏消毒并不能完全确保安全。部分人群食用生鸡蛋可能引发过敏反应，加热可破坏致敏蛋白的抗原性。传统溏心蛋的加热温度不足，仍建议完全加热至蛋黄凝固。
建议选择充分加热的鸡蛋食用，水煮蛋、蒸蛋羹等方式能最大限度保留营养。储存鸡蛋时应冷藏并尽快食用，烹饪前需清洁蛋壳表面。老年人、孕妇及免疫力低下者应避免食用含生鸡蛋的沙拉酱、冰淇淋等食品。若需补充蛋白质，熟鸡蛋的净蛋白质利用率显著高于肉类和乳制品。
